阿里云免費向全球機構(gòu)開放病毒檢測技術(shù) 再次用技術(shù)“搶奪”寶貴時間

            發(fā)布時間:2020-03-13 14:08:31  |  來源:中國新聞網(wǎng)  

            中新網(wǎng)3月13日電 3月13日,阿里云對外宣布,將向全球醫(yī)療科研機構(gòu)、疾控中心等一線病毒研究機構(gòu)免費開放云上病毒比對服務(wù),可大幅提升病毒基因檢測效率,最快只需60秒即可完成包括新冠病毒在內(nèi)的任意病毒基因?qū)Ρ裙ぷ?,對進一步了解病毒變異提供有效依據(jù)。這是繼此前宣布AI算力免費后,阿里云再次用技術(shù)“搶奪”寶貴時間。

            病毒經(jīng)過數(shù)代傳播,會產(chǎn)生變異,追蹤掌握病毒變異情況成為科研人員的重中之重。宏基因組測序mNGS是目前較為有效的追蹤方案,配合病毒庫可精準(zhǔn)確定病毒的代際關(guān)系,甚至找到病毒源發(fā)地。

            但此前的mNGS數(shù)據(jù)分析較為耗時,以某新冠重癥患者為例,系統(tǒng)需要對2200萬個序列超過32億個堿基一一和病毒庫比對,檢測出新冠病毒特征區(qū)域的完全匹配系列,通常這一過程需要30分鐘或更久。

            此次阿里云免費開放的基因計算服務(wù)AGS(Alibaba Genomics Service),采用容器技術(shù)和GPU,即開即用,可同時運行多個病毒基因比對服務(wù),大大縮短了這一進程,60秒內(nèi)即可獲取高質(zhì)量的基因比對報告,為患者提供更為準(zhǔn)確的醫(yī)療方案。

            包括疾控中心、各大高校、醫(yī)院、基因企業(yè)等一線病毒研究機構(gòu)可在阿里云上申請快速開通基因計算服務(wù),為進一步研究病毒蛋白質(zhì)及變異提供準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)支撐。

            目前,國內(nèi)基因公司安諾優(yōu)達已開始借助阿里云的計算能力從某腫瘤樣本數(shù)據(jù)中尋找病毒相關(guān)序列的數(shù)據(jù),用于研究病毒活動與某腫瘤發(fā)生的相關(guān)性。

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